{"id":4790,"date":"2024-05-16T09:34:45","date_gmt":"2024-05-16T07:34:45","guid":{"rendered":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/?p=4790"},"modified":"2024-10-07T15:18:20","modified_gmt":"2024-10-07T13:18:20","slug":"dna","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/","title":{"rendered":"Basen lezen doe je zo"},"content":{"rendered":"\n

Optische module van Illumina HiSeq<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Heb je altijd al willen weten hoe men DNA leest? Maak dan kennis met de optische module van de HiSeq 1500 van Illumina (op de foto zichtbaar onder het scherm). Dit apparaat lijkt misschien op een combinatie van een computer en een printer maar eigenlijk dient het om de volgorde van basen te bepalen. DNA bestaat uit vier verschillende basen waarmee een dubbele helix wordt gevormd. De bepaling van de volgorde van basen noemt men ook wel DNA-sequencing. Sinds de ontwikkeling van DNA-sequentiebepaling in 1975 onderging deze methode een grote evolutie. Aanvankelijk was dit proces duur en arbeidsintensief, tot de komst van Next Generation Sequencing (NGS) in 2005. Dit toestel kan miljoenen DNA-sequenties gelijktijdig uitlezen. Het betekende een gigantische vooruitgang in het genetisch onderzoek.<\/strong><\/p>\n\n\n\n

\n

Meer weten over de werking van DNA?<\/a><\/em><\/p>\n<\/blockquote>\n\n\n\n

\"\"
Afbeelding van DNA, Bron: Structure Of DNA Free Stock Photo – Public Domain Pictures<\/a><\/em><\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

De module bevat optische componenten die dubbele oppervlaktebeeldvorming van de flowcell mogelijk maken. Een grote hoeveelheid DNA-fragmenten wordt op een glazen plaatje gebonden, ook wel drager of flow cell genoemd. Tijdens de aanmaak van DNA-fragmenten labelt het apparaat de ingebouwde fluoroforen met vier verschillende kleuren voor de vier verschillende basen. Een laser bestraalt deze ingebouwde fluoroforen via spiegels en lenzen. Vervolgens zal licht met een bepaalde golflengte uitgestraald worden. Dit licht wordt via andere spiegels en lenzen opgevangen in de detector voor analyse van de basen. Het resultaat wordt verwerkt, gefilterd en gesorteerd voor verder genetische analyse.<\/p>\n\n\n\n

\"\"
Afbeelding van een flow cell<\/em><\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Illumina was met het HiSeq-toestel wereldwijd het eerste bedrijf dat een gebruiksvriendelijk, geautomatiseerd toestel op de markt bracht voor Next Generation Sequencing. In 2012 installeerde de dienst Centrum Medische Genetica (CMG) in Antwerpen een HiSeq-toestel. Hierdoor was het een van de eerste onderzoeksinstellingen in Antwerpen die Next Generation Sequencing kon toepassen. Na de productie van de eerste HiSeq 1500-toestellen kwamen al snel nieuwere modellen uit. Deze waren effici\u00ebnter en goedkoper, waardoor de nieuwere apparaten de HiSeq in 2017 op de dienst CMG vervingen. Vanaf 2023 werd de uitgave van de HiSeq 1500 stopgezet.<\/p>\n\n\n\n

Veel toestellen in moderne laboratoria zijn zogenaamde black boxes of gesloten dozen die weinig tot de verbeelding spreken. Met het tonen en bewaren van dit onderdeel willen we de werking ervan demonstreren. Daarnaast willen we ook het belang ervan benadrukken en de pioniersrol die Universiteit Antwerpen speelde in de beginjaren van Next Generation Sequencing aanduiden. Ondanks de korte periode waarin men het toestel gebruikte, verschafte het ons toegang tot een enorme waaier van nieuwe toepassingen. Het is intussen mogelijk om het volledige humaan genoom te lezen voor 300 dollar in slechts enkele dagen tijd, wat veel goedkoper en sneller is dan vroeger.<\/p>\n\n\n\n

Wil je meer weten over de toepassingen van Next Generation Sequencing?<\/a><\/em><\/p>\n\n\n\n

Tekst: Charlotte Claes<\/em><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Optische module van Illumina HiSeq<\/p>\n","protected":false},"author":15,"featured_media":5079,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[127],"tags":[129,130,140,139],"class_list":["post-4790","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-verhalenvertellers","tag-dna","tag-geneeskunde","tag-microscoop","tag-technologie"],"acf":[],"yoast_head":"\nBasen lezen doe je zo - Blog Collectief Geheugen UAntwerpen<\/title>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"nl_BE\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Basen lezen doe je zo - Blog Collectief Geheugen UAntwerpen\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"Optische module van Illumina HiSeq\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"Blog Collectief Geheugen UAntwerpen\" \/>\n<meta property=\"article:published_time\" content=\"2024-05-16T07:34:45+00:00\" \/>\n<meta property=\"article:modified_time\" content=\"2024-10-07T13:18:20+00:00\" \/>\n<meta property=\"og:image\" content=\"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-content\/uploads\/2024\/05\/hires-hiseq2500-right.jpg\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:width\" content=\"1950\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:height\" content=\"1405\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:type\" content=\"image\/jpeg\" \/>\n<meta name=\"author\" content=\"Vacily Meysman\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Geschreven door\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"Vacily Meysman\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Geschatte leestijd\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"3 minuten\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\\\/\\\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"Article\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/dna\\\/#article\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/dna\\\/\"},\"author\":{\"name\":\"Vacily Meysman\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/#\\\/schema\\\/person\\\/3283c5f0123e13909dd698f6f5b4fb20\"},\"headline\":\"Basen lezen doe je zo\",\"datePublished\":\"2024-05-16T07:34:45+00:00\",\"dateModified\":\"2024-10-07T13:18:20+00:00\",\"mainEntityOfPage\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/dna\\\/\"},\"wordCount\":460,\"publisher\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/#organization\"},\"image\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/dna\\\/#primaryimage\"},\"thumbnailUrl\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2024\\\/05\\\/hires-hiseq2500-right.jpg\",\"keywords\":[\"DNA\",\"Geneeskunde\",\"Microscoop\",\"Technologie\"],\"articleSection\":[\"Verhalenvertellers\"],\"inLanguage\":\"nl-BE\"},{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/dna\\\/\",\"url\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/dna\\\/\",\"name\":\"Basen lezen doe je zo - Blog Collectief Geheugen UAntwerpen\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/#website\"},\"primaryImageOfPage\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/dna\\\/#primaryimage\"},\"image\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/dna\\\/#primaryimage\"},\"thumbnailUrl\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2024\\\/05\\\/hires-hiseq2500-right.jpg\",\"datePublished\":\"2024-05-16T07:34:45+00:00\",\"dateModified\":\"2024-10-07T13:18:20+00:00\",\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/dna\\\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"nl-BE\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/dna\\\/\"]}]},{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"nl-BE\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/dna\\\/#primaryimage\",\"url\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2024\\\/05\\\/hires-hiseq2500-right.jpg\",\"contentUrl\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2024\\\/05\\\/hires-hiseq2500-right.jpg\",\"width\":1950,\"height\":1405},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/dna\\\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Home\",\"item\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Basen lezen doe je zo\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/#website\",\"url\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/\",\"name\":\"Blog Collectief Geheugen UAntwerpen\",\"description\":\"Universiteit Antwerpen Collectief Geheugen\",\"publisher\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/#organization\"},\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":{\"@type\":\"PropertyValueSpecification\",\"valueRequired\":true,\"valueName\":\"search_term_string\"}}],\"inLanguage\":\"nl-BE\"},{\"@type\":\"Organization\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/#organization\",\"name\":\"Blog Collectief Geheugen UAntwerpen\",\"url\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/\",\"logo\":{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"nl-BE\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/#\\\/schema\\\/logo\\\/image\\\/\",\"url\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2021\\\/09\\\/cropped-UA-hor-1-nl-white.png\",\"contentUrl\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2021\\\/09\\\/cropped-UA-hor-1-nl-white.png\",\"width\":873,\"height\":250,\"caption\":\"Blog Collectief Geheugen UAntwerpen\"},\"image\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/#\\\/schema\\\/logo\\\/image\\\/\"}},{\"@type\":\"Person\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/#\\\/schema\\\/person\\\/3283c5f0123e13909dd698f6f5b4fb20\",\"name\":\"Vacily Meysman\",\"url\":\"https:\\\/\\\/blog.uantwerpen.be\\\/collectief-geheugen\\\/author\\\/vacily-meysman\\\/\"}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Basen lezen doe je zo - Blog Collectief Geheugen UAntwerpen","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/","og_locale":"nl_BE","og_type":"article","og_title":"Basen lezen doe je zo - Blog Collectief Geheugen UAntwerpen","og_description":"Optische module van Illumina HiSeq","og_url":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/","og_site_name":"Blog Collectief Geheugen UAntwerpen","article_published_time":"2024-05-16T07:34:45+00:00","article_modified_time":"2024-10-07T13:18:20+00:00","og_image":[{"width":1950,"height":1405,"url":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-content\/uploads\/2024\/05\/hires-hiseq2500-right.jpg","type":"image\/jpeg"}],"author":"Vacily Meysman","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"Geschreven door":"Vacily Meysman","Geschatte leestijd":"3 minuten"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"Article","@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/#article","isPartOf":{"@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/"},"author":{"name":"Vacily Meysman","@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/#\/schema\/person\/3283c5f0123e13909dd698f6f5b4fb20"},"headline":"Basen lezen doe je zo","datePublished":"2024-05-16T07:34:45+00:00","dateModified":"2024-10-07T13:18:20+00:00","mainEntityOfPage":{"@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/"},"wordCount":460,"publisher":{"@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/#organization"},"image":{"@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/#primaryimage"},"thumbnailUrl":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-content\/uploads\/2024\/05\/hires-hiseq2500-right.jpg","keywords":["DNA","Geneeskunde","Microscoop","Technologie"],"articleSection":["Verhalenvertellers"],"inLanguage":"nl-BE"},{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/","url":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/","name":"Basen lezen doe je zo - Blog Collectief Geheugen UAntwerpen","isPartOf":{"@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/#website"},"primaryImageOfPage":{"@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/#primaryimage"},"image":{"@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/#primaryimage"},"thumbnailUrl":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-content\/uploads\/2024\/05\/hires-hiseq2500-right.jpg","datePublished":"2024-05-16T07:34:45+00:00","dateModified":"2024-10-07T13:18:20+00:00","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/#breadcrumb"},"inLanguage":"nl-BE","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/"]}]},{"@type":"ImageObject","inLanguage":"nl-BE","@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/#primaryimage","url":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-content\/uploads\/2024\/05\/hires-hiseq2500-right.jpg","contentUrl":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-content\/uploads\/2024\/05\/hires-hiseq2500-right.jpg","width":1950,"height":1405},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/dna\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Home","item":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Basen lezen doe je zo"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/#website","url":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/","name":"Blog Collectief Geheugen UAntwerpen","description":"Universiteit Antwerpen Collectief Geheugen","publisher":{"@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/#organization"},"potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/?s={search_term_string}"},"query-input":{"@type":"PropertyValueSpecification","valueRequired":true,"valueName":"search_term_string"}}],"inLanguage":"nl-BE"},{"@type":"Organization","@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/#organization","name":"Blog Collectief Geheugen UAntwerpen","url":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/","logo":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"nl-BE","@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/#\/schema\/logo\/image\/","url":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/cropped-UA-hor-1-nl-white.png","contentUrl":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/cropped-UA-hor-1-nl-white.png","width":873,"height":250,"caption":"Blog Collectief Geheugen UAntwerpen"},"image":{"@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/#\/schema\/logo\/image\/"}},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/#\/schema\/person\/3283c5f0123e13909dd698f6f5b4fb20","name":"Vacily Meysman","url":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/author\/vacily-meysman\/"}]}},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/4790","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-json\/wp\/v2\/users\/15"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=4790"}],"version-history":[{"count":5,"href":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/4790\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":5489,"href":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/4790\/revisions\/5489"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-json\/wp\/v2\/media\/5079"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=4790"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=4790"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/blog.uantwerpen.be\/collectief-geheugen\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=4790"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}